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分析脑瘤基因组,IBM人工智能只要10分钟,比人类160小时分析更全

来源:未知 发布时间:2017-07-19 18:12

随着肿瘤靶向治疗和个性化治疗办法的不断先进,越来越多的医生意识到了对肿瘤进行基因组测序的重要性。从肿瘤基因组分析中往往能找到更有针对性和更有效的靶向治疗方案,为患者带来更好的疗效。不外,从大批的基因组数据中迅速找到潜在的治疗方案并不是一件轻易的事件,但这却是盘算机和人工智能程序可能施展作用的地方。

最近,IBM和纽约基因组中心合作发表了一项研究,IBM的沃森人工智能系统在分析一位脑瘤患者的基因组数据上通过少得多的时间,得到了和一组专家相同的成果。这项研究发表在了最近的《Neurology Genetics》杂志上。

IBM沃森剖析了脑肿瘤的基因组数据。图片起源:fiercebiotech

这项探索性的研究是在一位胶质母细胞瘤的患者身长进行的。胶质母细胞瘤是一种非常凶险的癌症,死亡率很高,确诊后的均匀存活时间不到15个月。对于这样的癌症患者来说,时间是极其名贵的,越早找到有针对性的治疗方案,就越有可能延长患者的性命。

早在2014年时,IBM就与纽约基因组中心展开了协作,基于IBM的沃森人工智能系统开发一个专门分析肿瘤基因组的程序,称之为沃森基因组分析。这个团队在这位患者身上试用了这个程序的β版本。它能够从超过2700万篇生物医学方面的论文中寻找针对特定基因变化的靶向治疗方案。

科研职员从这位患者身上获取了肿瘤的活检样本以及一份血样,并对两份样品中的DNA和肿瘤中的RNA进行了测序。为了进行比较,这些测序数据被分离送给了IBM沃森基因组程序和一个由生物信息学家和肿瘤学家组成的专家团队进行分析。沃森系统仅仅用了10分钟就完成了一份可供考虑的临床治疗方案的报告,而专家组的人工分析花了160个小时,才得到了一份相似的报告。沃森系统甚至还比专家组找到了更多的可能进行靶向治疗的基因突变。

这项研究的通信作者、纽约基因组中心开创人兼主管、洛克菲勒大学教学Robert Darnell博士表现:“我们的配合摸索了利用基因组学赞助癌症患者的前沿挑衅和机会。我们供给了对于两个要害问题的初步意见:从不同的贸易或研究用癌症基因组平台中可以提取哪些临床价值,以及如何斟酌扩展该价值的用途。”

沃森基因组程序的创新首脑Vanessa Michelini以为:“这项研究展示了沃森基因组程序在辅助医生扩大精准肿瘤治疗方案的应用上的伟大潜力。癌症基因组学的临床研究领军人物正在将精准医学应用到癌症患者方面获得宏大的进展,但分析基因组数据还是一个很大的障碍,那就是沃森可以帮助的处所。”

这项研究是纽约基因组中心推进下一代测序技巧在精准医疗中的应用的尽力的一部分。为了进一步验证和改良沃森基因组程序,纽约基因组中心正在进行一项更大规模的胶质母细胞瘤试验,以及另一项有多达200名各种癌症患者加入的实验。

我们希望这个程序可以早日取得广泛的应用,为更多癌症患者带来精准治疗计划。

参考资料

[1] IBM Watson takes on whole-genomesequencing of brain tumor in early study

[2] Study by New York Genome Center and IBMDemonstrates Potential for AI and Whole Genome Sequencing to Scale Access toPrecision Medicine

[3] Comparing sequencing assays andhuman-machine analyses in actionable genomics for glioblastoma

来源:康健新视线(微信号 HealthHorizon)



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